北京大学肿瘤医院胃肠肿瘤中心二病区拥有的胃肠肿瘤诊疗和研究团队，比肩国际胃肠诊疗中心。共开放床位29张，专长于进展期胃肠肿瘤的手术和综合、早期胃癌的保留功能手术、低位直肠保肛手术等。主治病种包括胃癌、结直肠癌、胃肠道间质瘤和其他少见胃肠道肿瘤。在多学科讨论的基础上，为每一位患者制定和实施为合理的诊疗规划。在中心主任季加孚院长的直接领导下，科室秉承北京大学肿瘤医院的优良传统，追求，不断进步，在临床、科研、教学等各方面均取得了令人欣喜的成果，保持稳健、严谨工作作风的同时，走上了高速发展的快车道。科室人员结构：1、人员构成：主任医师3人，副主任医师6人，主治医师7人，住院医师2人，护理人员17人。2. 科室主要领导：胃肠肿瘤中心主任季加孚，科主任步召德，护士长赵旻。
科室特色包括：微创手术、外科、疑难手术、功能保留手术、快速康复、病人全程管理。
北京大学肿瘤医院胸部肿瘤内二科以肺癌、恶性胸腺瘤、胸膜间皮瘤等为主要病种，具有丰富的临床经验、先进的理念，规范基础上的个体化诊疗为特点。科室追踪国际研究进展，结合数十年临床经验，为患者量身打造规范合理的综合方案，擅长各种类型肺癌的内科及综合(化疗、靶向)，规范的癌症疼痛处理及姑息，同时开展气管镜诊治肺部肿物。我科每周与胸外科、放疗科、介入科、中医科、影像科、病理科、核医学科进行肺癌多学科联合会诊，为患者提供、便捷合理的综合诊治安排。
胸部肿瘤内二科形成了高学历高素质、以患者为中心、积极进取的医疗团队，训练有素、敬业有爱心的护理团队，全科医护人员30人，医师中具有博士学历者占70%。
北京大学肿瘤医院淋巴瘤科是我国成立早的淋巴瘤专业科室，经历了36年的发展历程，已经成为我院的特色品牌科室之一，目前拥有普通病床36张，移植舱位4张，专业从事淋巴瘤的临床诊断与、以及自体干细胞移植。收治患者全部为各类型淋巴瘤患者，几乎涵盖世界卫生组织淋巴瘤分类的全部亚型。
我科现有临床医生12人，其中正副主任医师7人、主治医师4人、住院医师1人;护士20人，专业科研人员和技术员各1人，科研护士2人。每年门诊接诊4000人次，新收治住院淋巴瘤患者400例，每月出院患者约200人次。
为了给患者提供更好的个体化综合诊治平台，2005年，以淋巴瘤科为主成立了院内淋巴瘤专业协作组，包括淋巴瘤内科、病理科、外科、放疗科、影像科、核医学科等等，对疑难病例进行全院会诊讨论。
在繁忙的日常工作之外，为了提高淋巴瘤的水平，促进学科发展，也为了给患者提供更多的机会和措施，我科先后承担了30余项国内外新药临床研究。同时作为医院品牌科室和国内少数淋巴瘤专业科室之一，承担了大量北京及外省市疑难病例会诊工作和学术讲座;承担北京大学医学部硕士、博士研究生及住院医师、进修医师、访问学者的部分培训工作;定期为患者及家人举办康复课堂教育活动等等。
感谢患者及家人的支持和理解，也感谢国内外同道的关注和鼓励，淋巴瘤科将继续秉承我院“院有品牌、科有特色、人有专长”的办院宗旨，为来自国内外的淋巴瘤患者提供优质规范的医疗服务和人性化的关怀照顾。
北京大学肿瘤医院黑色素瘤与肉瘤内科，始建于2005年，通过十余年的快速发展，科室具有强大的医疗科研团队，开设本院、南院共两个病区，以及临床转化实验室。年门诊量30000余人次，收治患者8000余人次。全科在编医生10名，研究人员2名, 合同医生1名，在编均为博士学位,其中主任医师4名，副主任医师4名，研究员1名，副研究员1名。学科带头人郭军主任，任Melanoma World Society (MWS) 副主席及中国临床肿瘤学会(CSCO)副理事长兼秘书长等职务。科室多人数次获得，市级人才培养计划。近年留学回国青年医师7人，与多家国际黑色素中心建立良好合作。