虽然申请办理银行承兑汇票时，银行要求申请人提供双方交易合同，但不能保证申请人在获得银行承兑汇票后，真正用这张票去履行该笔合同。通常，银行在作出承兑后，不再去管汇票的流向和其实际的用途，只是到期负责支付汇票款项。
在实际操作上银行在开具银行承兑汇票的时候，对其他票据的审核流于形式或根本就无需提供，银行在开具相关金额的汇票时会从申请人的账户上先行扣除票面金额，如账户金额不足的话是不给予开具的，即银行只审核资金是否充足。
而申请国内信用证，在银行的审核上如同贷款的审核流程。更多审核的是合同内容与事实相符。
银行承兑汇票是银行到期无条件付款，承兑银行见到到期的银行承兑汇票后，只要审核汇票背书连续及汇票的真实性后即可付款：而国内信用证开证(议付)行必须审核信用证及其所附单据，保证单证相符、单单相符后方可付款。银行承兑汇票一般都是在汇票到期日由承兑银行支付款项，而国内信用证的付款期限可分为即期付款和延期付款(两者都要在信用证有效期内)，即期付款是指开证行在收到受益人提交的符合信用证要求的单据后，立即向受益人支付款项(一般是在五个工作日内)，延期付款是指在货物发运日后某一日付款。其中，即期付款的国内信用证和银行承兑汇票不同，它没有到期日的概念，随到随付。
国内信用证可以根据买方，或者卖方的要求进行修改，往往是贸易双方对合同上的条款进行了修改，相应地对信用证上的条款也进行修改，甚至修改信用证金额，这就给交易双方带来了方便。而银行承兑汇票上的金额不能进行修改，也不能对部分金额进行背书转让，只能以此金额终办理结算。这也是一些客户将大额银行承兑汇票质押给银行，重新签开若干小额承兑汇票用于不同用途支付的主要原因。