长期从事风湿临床免疫基础和临床研究。首次发现：新生抗原介导了强直性脊柱炎发病，是该领域里程碑式重大发现（Science，2023）；类风湿关节炎滑膜中铁死亡机制；CD147是病毒和疟原虫入侵人体新受体。研发成功抗恶性疟疾和重症新冠病毒感染特异创新；建立了炎性关节炎内外科综合诊疗关键技术体系，首先提出“AS合并髋关节炎MRI评估标准”，主持建立《ANCA检测技术》和《中轴型脊柱关节炎综合评估》中国专家共识。
1993年12月，时任传染科副主任医师、副教授的朱平已在传染病领域积累了丰富的临床经验，关于流行性出血热发病机制的研究项目获得军队科技进步二等奖，但她毅然服从医院发展需要的安排，调任至彼时“一穷二白”的免疫科，从头做起。
炎性关节炎发病率、致残率和复发率高，严重危害人类健康。作为学科带头人，朱平带领团队实现多项突破，例如，在国际上建立磁共振成像定量诊断评价强直性脊柱炎髋关节受累的标准；国内开展炎性关节炎内外科综合诊治新模式，在提高类风湿关节炎和强直性脊柱炎等的临床早期诊治率和率方面作出重要贡献，让数十万患者“挺直了脊梁”。
朱平医术精湛，不少省外患者慕名而来。她总是说：“他们来一次不容易，能少跑一趟是一趟，能省住宿费就省。”为了给患者减轻经济负担，她仔细分析病情，确立完善的诊疗方案，让病人少花钱、少奔波。每逢坐诊，她常常自愿延长门诊时间，态度和善、耐心细致地接待完后一名患者才下班。