办理投标保函的流程相对严谨，但每一步都至关重要。以下是具体的办理步骤：
1、准备资料：
招标文件资料：包括招标公告、招标文件等。
基础交易合同资料及履约记录：提供公司对同类项目的履约记录，以证明公司的履约能力和信誉。
常规授信资料：如营业执照、法人代码证书、税务登记证、财务报表、公司决议等，这些资料是银行评估申请人资质的重要依据。
保函格式：通常招标文件中会提供要求的保函格式文本，申请人需按照要求填写。
2、填写申请：
申请人需填写《保函申请书》，并附上上述所有准备好的资料。
3、银行审查：
银行将对申请人的申请内容进行审查，包括资质、信用状况、履约能力等。
4、签订协议：
审查通过后，银行与申请人签订协议，明确双方的权利和义务。申请人需按照协议要求提供相应的担保措施。
5、开立保函：
银行根据协议内容，为申请人开立投标保函。保函的有效期一般不超过六个月，从开出之日起生效。
6、提交保函：
申请人将开立好的投标保函随同投标文件一并提交给招标人。
预付款保函在国际承包业务中使用时，是由承包人通过银行向业主提供。保证书规定，如申请人不履行他与受益人订立的合同的义务，不将受益人预付、支付的款项退还或还款给受益人，则由银行向受益人退还该款项。
预付款保函除在国际工程承包项目中使用外，也适用于货物进出口、劳务合作和技术贸易等业务。例如，在成套设备及大型交通工具的合同中，通常采用带有预付性质的分期付款或延期付款支付部分价款。在这种交易中，进口人在签订合同后，向出口人开立履约保证书，由银行保证进口人按合同规定按期支付价款，同时，出口人也向对方开立还款保证书。如出口人不能按期交货，银行保证及时偿还进口人已付款项的本金及所产生的利息。
保函的共同优点：
1、减少由于缴纳现金保证金引起的长时间资金占压，获得资金收益;
2、与缴纳现金保证金相比，可以使有限的资金得到优化配置;权益得到更好地维护。
3、对业主或买方：合理制约承包人、供货方行为，良好维护自身利益;避免收取、退回保证金程序的繁琐，提高工作效率。
如何理解保函的直开、转开？
1、保函直开：即所谓“直接担保”，是指担保银行应和同一方当事人申请，向合同另一方开立以其为受益人的保函，并凭此直接向受益人承担支付责任的保函开立方式。
2、保函转开：又称“间接担保”，是指申请人所在地银行应客户要求，根据标书或有关合同的有关规定以及受益人所在地惯常做法及法律要求，以提供反担保的形式来委托另一家银行（通常为受益人所在地银行）代其出具保函，并由后者向受益人承担付款责任。